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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms 4 KP

Semester Herbstsemester 2020
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. We will discuss both "classical" topics such as Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees and "modern" approaches based on sophisticated (deep) learning models.
Lernziele This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students get an overview of modern machine learning methods and their applications to bio-medical problems.
Literatur R. Durbin: Biological sequence analysis
Aaron C. Courville, Ian Goodfellow und Yoshua Bengio: Deep Learning

 

Teilnahmebedingungen Mathematische Methoden I
Mathematische Methoden II
Einführung in die Statistik
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall wöchentlich
Datum 17.09.2020 – 17.12.2020
Zeit Donnerstag, 14.15-16.00 - Online Präsenz -
Datum Zeit Raum
Donnerstag 17.09.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 24.09.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 01.10.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 08.10.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 15.10.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 22.10.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 29.10.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 05.11.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 12.11.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 19.11.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 26.11.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 03.12.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 10.12.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Donnerstag 17.12.2020 14.15-16.00 Uhr - Online Präsenz -, --
Module Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach Informatik)
Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics)
Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach Computer Science)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Oral exam
Date: Wednesday, 16 December 2020 and Thursday, 17 December 2020
Room: Spiegelgasse 1, Office 06.003
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Fachbereich Informatik

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