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46377-01 - Vorlesung: Molecular Modeling in Drug Design 1 KP

Semester Frühjahrsemester 2019
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Martin Smiesko (martin.smiesko@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt Series of advanced lectures offering critical insights into the most relevant molecular modeling methods and topics in the modern drug design. Areas covered by the lectures:
- Encoding, storing and retrieving of chemical information
- Virtual Screening
- (Combinatorial) Library design
- Scaffold hopping & de novo design
- Molecular docking and scoring
- Calculation of pharmaceutically relevant physico-chemical properties and descriptors
- Molecular Dynamics Simulations

Complemented by examples from the literature and in-house research
Lernziele Advanced overview of computational and modeling methods in drug design.
In-depth understanding of the state-of-the-art techniques employed in the modern rational drug design, including their strenghts and weaknesses.
Critical interpretation of a selected scientific publication in the field.
Literatur A.R.Leach: Molecular Modelling: Principles and Applications, ISBN-13: 978-0582382107
J. Med. Chem. 2016, 59, 4087−4102, DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5b01875
Nat Rev Drug Discov. 2013, 12(12), 948-62. DOI:10.1038/nrd4128
PLoS One. 2012, 7(11), e48476. DOI:10.1371/journal.pone.0048476
Bemerkungen Film and sound recordings during the course are strictly forbidden (recorders may be confiscated
Weblink www.modeling.unibas.ch

 

Teilnahmebedingungen Attended lecture series 12205-01 "Einführung ins Molecular Modeling". Basic experience with molecular modeling software required.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz
HörerInnen willkommen

 

Intervall Wochentag Zeit Raum

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Modul: General Skills and Experimental Tools (Masterstudium: Drug Sciences)
Wahlbereich Master Pharmazie: Empfehlungen (Masterstudium: Pharmazie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung 100% Attendance
Electronic report based on a case study from the literature (application of molecular modeling method(s) in the drug design)
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Pharmazeutische Wissenschaften

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