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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms 4 KP

Semester Herbstsemester 2019
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. Covered topics include Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees, sampling and annealing methods, and methods for sequence alignment.
Lernziele This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students are familiar with advanced sampling and annealing methods and their applications in bioinformatics.
Literatur R. Durbin: Biological sequence analysis
Weblink link to course web page

 

Teilnahmebedingungen Mathematische Methoden I
Mathematische Methoden II
Einführung in die Statistik
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach: Informatik)
Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics)
Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach: Computer Science)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Oral exam
expected date: Wednesday, 18 December and Thursday, 19 December 2019
Room: Office 06.003
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Fachbereich Informatik

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