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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms (4 KP)
| Semester | Herbstsemester 2020 |
| Weitere Semesterveranstaltungen zu diesen KP |
45401-01 (Vorlesung) 45401-02 (Übung) |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende | Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn) |
| Inhalt | In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. We will discuss both "classical" topics such as Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees and "modern" approaches based on sophisticated (deep) learning models. |
| Lernziele | This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students get an overview of modern machine learning methods and their applications to bio-medical problems. |
| Literatur | R. Durbin: Biological sequence analysis Aaron C. Courville, Ian Goodfellow und Yoshua Bengio: Deep Learning |
| Teilnahmevoraussetzungen | Mathematische Methoden I Mathematische Methoden II Einführung in die Statistik |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|
Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.
| Module |
Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach: Informatik) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science) Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science) Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach: Computer Science) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | Oral exam Date: Wednesday, 16 December 2020 and Thursday, 17 December 2020 Room: Spiegelgasse 1, Office 06.003 |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | 1-6 0,5 |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Fachbereich Informatik |