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11830-01 - Vorlesung: Computational Chemistry: Atomistic Simulations of Proteins and Macromolecules (VTV) 3 KP

Semester Herbstsemester 2008
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Markus Meuwly (m.meuwly@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt Historical overview
Coordinate systems, rotations
Intermolecular interactions, force fields
Optimization techniques (non-gradient, gradient) and saddle points
Harmonic analysis
Classical dynamics
Molecular dynamics (MD) simulations
Monte Carlo (MC) simulations
Analysis of data
Application I: Protein-ligand binding
Application II: Peptide and protein folding
Advances topics
Lernziele Verstehen des Konzeptes eines Kraftfeldes
Selbständiges Durchführen einer vollständigen Molekulardynamik-Simulation
Literatur Molecular Modeling, Andrew. R. Leach
Computer Simulations of Liquids, Allen and Tildesley

 

Unterrichtssprache Deutsch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Modul Computational Chemistry (Bachelor in Computational Sciences)
Modul Computational Physics (Bachelor in Computational Sciences) (Pflicht)
Modul Computational Sciences II (Bachelor in Computational Sciences)
Modul Vertiefungsfach Chemie (Master Nanowissenschaften)
Vertiefungsmodul (Master Chemie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Vortrag (5 Minuten) zu einer Simulationsaufgabe
Mündliche Prüfung, 30 Minuten
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anmelden: Belegen; Abmelden: Dozierende
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Chemie

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