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| Semester | Herbstsemester 2017 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, BeurteilerIn)
Adam Mazur (adam.mazur@unibas.ch) Michael Podvinec (michael.podvinec@unibas.ch) |
| Inhalt | Day 1: Analysis of structural and biophysical data with Python. Numerical Python modules: NumPy, SciPy, Pandas. Data visualization: Matplotlib Day 2: Working with protein structures and sequences: Biopython, OpenStructure and PyMOL Day 3: Practical session, ideally with application to participants' research projects The course will cover the essentials of practical Python programming for structural biology. It is designed for PhD and MSc students who already have basic knowledge in Python programming and would like to learn how to enhance their skills to solve realistic cases in the field of structural biology. The focus will be put on acquiring practical knowledge about Python modules relevant to structural biology, numerical analysis and visualization. The course days consist of an introductory presentation on the basic concepts and best practices, followed by practical exercises, during which participants can apply the acquired skills. |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: basic experience in Python programming (e.g. course E7: Programming for Life Sciences 43513) Der Kurs muss vollständig besucht werden, ansonsten können die CPs nicht vergeben werden. |
| Anmeldung zur Lehrveranstaltung | angie.klarer@unibas.ch Angelika Klarer Klingelbergstrasse 70 4056 Basel |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|
Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.
| Module |
Cycle I: Practical and Experimental Skills (Master Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |