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46377-01 - Vorlesung: Molecular Modeling in Drug Design 1 KP

Semester Frühjahrsemester 2019
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Martin Smiesko (martin.smiesko@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt Series of advanced lectures offering critical insights into the most relevant molecular modeling methods and topics in the modern drug design. Areas covered by the lectures:
- Encoding, storing and retrieving of chemical information
- Virtual Screening
- (Combinatorial) Library design
- Scaffold hopping & de novo design
- Molecular docking and scoring
- Calculation of pharmaceutically relevant physico-chemical properties and descriptors
- Molecular Dynamics Simulations

Complemented by examples from the literature and in-house research
Lernziele Advanced overview of computational and modeling methods in drug design.
In-depth understanding of the state-of-the-art techniques employed in the modern rational drug design, including their strenghts and weaknesses.
Critical interpretation of a selected scientific publication in the field.
Literatur A.R.Leach: Molecular Modelling: Principles and Applications, ISBN-13: 978-0582382107
J. Med. Chem. 2016, 59, 4087−4102, DOI: 10.1021/acs.jmedchem.5b01875
Nat Rev Drug Discov. 2013, 12(12), 948-62. DOI:10.1038/nrd4128
PLoS One. 2012, 7(11), e48476. DOI:10.1371/journal.pone.0048476
Bemerkungen Film and sound recordings during the course are strictly forbidden (recorders may be confiscated


Teilnahmebedingungen Attended lecture series 12205-01 "Einführung ins Molecular Modeling". Basic experience with molecular modeling software required.
Unterrichtssprache Englisch
Weblink www.modeling.unibas.ch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz
HörerInnen willkommen


Intervall wöchentlich
Datum 22.02.2019 – 12.04.2019
Zeit Freitag, 13.15-15.00 Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Datum Zeit Raum
Freitag 22.02.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 01.03.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 08.03.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 15.03.2019 13.15-15.00 Uhr Fasnachtsferien
Freitag 22.03.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 29.03.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 05.04.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Freitag 12.04.2019 13.15-15.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Kiwi
Module Modul General Skills and Experimental Tools (Master Drug Sciences)
Wahlbereich Master Pharmazie: Empfehlungen (Master Pharmazie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung 100% Attendance
Electronic report based on a case study from the literature (application of molecular modeling method(s) in the drug design)
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Pharmazeutische Wissenschaften