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34604-01 - Vorlesung mit Praktikum: Introduction to protein interaction analysis by affinity purification - mass spectrometry 1 KP

Semester Frühjahrsemester 2019
Angebotsmuster unregelmässig
Dozierende Thomas Bock (thomas.bock@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexander Schmidt (alex.schmidt@unibas.ch)
Inhalt 3-day practical course on affinity purification - mass spectrometry (AP-MS) based investigation of protein-protein interactions and posttranslational modifications. This course focuses on the protein interaction analysis of protein phosphatase complexes, which have been linked to the regulation of a number of fundamental biological processes (e.g. cell growth, apoptosis and more) and are involved in cellular transformation during tumorgenesis.

Day 1: Sample preparation
Seminar: Introduction to AP-MS workflows, advantages/disadvantages of different protein affinity tags/enrichment strategies
Hands-on training: Affinity purification of one target protein per student (each student can bring one additional protein of interest for purification via affinity resins), protein digestion over night.
Day 2: Mass spectrometric analysis
Seminar: Introduction to mass spectrometry (MS) and its applications in molecular biology
Hands-on training: Solid-phase extraction of peptides, mass spectrometric measurement.
Day 3: Data analysis
Seminar: Introduction to MS-data analysis, principles of protein identification.

 

Teilnahmebedingungen The courses are limited to a maximum of 6 participants.
The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.
Anmeldung zur Lehrveranstaltung Angelika Klarer
Klingelbergstrasse 70
4056 Basel
Angie.Klarer@unibas.ch
Unterrichtssprache Englisch
Weblink Graduate Teaching Program
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Datum 11.06.2019 – 13.06.2019
Zeit

Course dates: 11.06.-13.06.2019

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Master Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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