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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms 4 KP

Semester Herbstsemester 2019
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. Covered topics include Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees, sampling and annealing methods, and methods for sequence alignment.
Lernziele This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students are familiar with advanced sampling and annealing methods and their applications in bioinformatics.
Literatur R. Durbin: Biological sequence analysis

 

Teilnahmebedingungen Mathematische Methoden I
Mathematische Methoden II
Einführung in die Statistik
Unterrichtssprache Englisch
Weblink link to course web page
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall wöchentlich
Datum 19.09.2019 – 19.12.2019
Zeit Donnerstag, 14.15-16.00 Kollegienhaus, Hörsaal 119
Datum Zeit Raum
Donnerstag 19.09.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 26.09.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 03.10.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 10.10.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 17.10.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 24.10.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 31.10.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 07.11.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 14.11.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 21.11.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 28.11.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 05.12.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 12.12.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Donnerstag 19.12.2019 14.15-16.00 Uhr Kollegienhaus, Hörsaal 119
Module Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach Informatik)
Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics)
Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach Computer Science)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Oral exam
expected date: Wednesday, 18 December and Thursday, 19 December 2019
Room: Office 05.010
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Fachbereich Informatik

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