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34604-01 - Vorlesung mit Praktikum: Introduction to Protein Interaction Analysis by Affinity Purification - Mass Spectrometry 1 KP (ABGESAGT)

Semester Frühjahrsemester 2021
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Thomas Bock (thomas.bock@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexander Schmidt (alex.schmidt@unibas.ch)
Inhalt 3-day practical course on affinity purification - mass spectrometry (AP-MS) based investigation of protein-protein interactions and posttranslational modifications. This course focuses on the protein interaction analysis of protein phosphatase complexes, which have been linked to the regulation of a number of fundamental biological processes (e.g. cell growth, apoptosis and more) and are involved in cellular transformation during tumorgenesis.

Day 1: Sample preparation
Seminar: Introduction to AP-MS workflows, advantages/disadvantages of different protein affinity tags/enrichment strategies
Hands-on training: Affinity purification of one target protein per student (each student can bring one additional protein of interest for purification via affinity resins), protein digestion over night.
Day 2: Mass spectrometric analysis
Seminar: Introduction to mass spectrometry (MS) and its applications in molecular biology
Hands-on training: Solid-phase extraction of peptides, mass spectrometric measurement.
Day 3: Data analysis
Seminar: Introduction to MS-data analysis, principles of protein identification.
Bemerkungen Postponed to spring semester 2022.
Weblink Graduate Teaching Program

 

Teilnahmebedingungen The courses are limited to a maximum of 6 participants. PhD students only.
The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.
Anmeldung zur Lehrveranstaltung Angelika Klarer
Klingelbergstrasse 70
4056 Basel
Angie.Klarer@unibas.ch
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
Bemerkungen Postponed to spring semester 2022.

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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