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34603-01 - Vorlesung mit Praktikum: A Practical Introduction to Biophysical Methods 2 KP

Semester Frühjahrsemester 2021
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Timothy Sharpe (timothy.sharpe@unibas.ch, BeurteilerIn)
Ludovit Zweifel (ludovit.zweifel@unibas.ch)
Inhalt This four-day course provides a practical and theoretical introduction of a range of biophysical methods that can be used to measure the stability, size, interactions and dynamics of biomolecules. Students will gain hands-on experience of different techniques, an idea of how those techniques can complement each other, and opportunities to discuss which techniques might be suitable for their own projects.

The techniques covered in the course will be: isothermal titration calorimetry (ITC), microscale thermophoresis (MST), surface plasmon resonance (SPR), differential scanning fluorimetry (DSF), analytical ultracentrifugation (AUC), dynamic light scattering (DLS), multi-angle light-scattering (MALS), fluorescence correlation spectroscopy (FCS), and fluorescence lifetime imaging (FLIM).

At the end of the course, students will be required to write a short proposal (2-4 pages) for the application of at least one of the techniques covered in the course to their own research project. The proposal should demonstrate a theoretical understanding of the technique, consideration of the sample requirements and experimental protocol, and ideas about the potential meaning of the results within the context of their project.

Day 1: Theory of binding interactions; ITC and MST experiments.
Day 2: Other methods to study binding; Advanced data analysis; Theory of protein stability; DSF experiments.
Day 3: Theory of mass and size determination; AUC data analysis; DLS and MALS experiments.
Day 4: Theory of time-resolved fluorescence imaging; FCS and FLIM experiments.
Bemerkungen The dates of the course will follow.
Weblink Graduate Teaching Program


Teilnahmebedingungen The courses are limited to a maximum of 4 participants, PhD students only.
The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.
Anmeldung zur Lehrveranstaltung Please register via:
Angelika Klarer (angie.klarer@unibas.ch)
Klingelbergstrasse 70
4056 Basel
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz


Intervall Block
Datum 01.03.2021 – 04.06.2021
Zeit Siehe Detailangaben

The dates of the course will follow.

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum