Zurück
| Semester | Herbstsemester 2021 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, BeurteilerIn)
Adam Mazur (adam.mazur@unibas.ch) Michael Podvinec (michael.podvinec@unibas.ch) |
| Inhalt | Day 1: Analysis of structural and biophysical data with Python. Numerical Python modules: NumPy, SciPy, Pandas. Data visualization: Matplotlib Day 2: Working with protein structures and sequences: Biopython, OpenStructure and PyMOL Day 3: Practical session, ideally with application to participants' research projects The course will cover the essentials of practical Python programming for structural biology. It is designed for PhD and MSc students who already have basic knowledge in Python programming and would like to learn how to enhance their skills to solve realistic cases in the field of structural biology. The focus will be put on acquiring practical knowledge about Python modules relevant to structural biology, numerical analysis and visualization. The course days consist of an introductory presentation on the basic concepts and best practices, followed by practical exercises, during which participants can apply the acquired skills. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: basic experience in Python programming (e.g. course E7: Programming for Life Sciences 43513). The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded. PhD students only. |
| Anmeldung zur Lehrveranstaltung | Please register via: phd-biozentrum@unibas.ch. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| Block | Siehe Einzeltermine | ||
| Bemerkungen | Course dates: January 10-12, 2022 |
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 10.01.2022 | 09.00-18.00 Uhr | Biozentrum, Computerraum Mango 02.081 |
| Dienstag 11.01.2022 | 09.00-18.00 Uhr | Biozentrum, Computerraum Mango 02.081 |
| Mittwoch 12.01.2022 | 09.00-18.00 Uhr | Biozentrum, Computerraum Mango 02.081 |
| Module |
Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | Detailed information on ADAM workspace. https://adam.unibas.ch/login.php. |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |