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| Semester | Herbstsemester 2021 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende | Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn) |
| Inhalt | In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. We will discuss both "classical" topics such as Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees and "modern" approaches based on sophisticated (deep) learning models. |
| Lernziele | This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students get an overview of modern machine learning methods and their applications to bio-medical problems. |
| Literatur | R. Durbin: Biological sequence analysis Aaron C. Courville, Ian Goodfellow und Yoshua Bengio: Deep Learning |
| Weblink | link to course web page |
| Teilnahmebedingungen | Mathematische Methoden I Mathematische Methoden II Einführung in die Statistik |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Donnerstag | 14.15-16.00 | - Online Präsenz - |
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Donnerstag 23.09.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 30.09.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 07.10.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 14.10.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 21.10.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 28.10.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 04.11.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 11.11.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 18.11.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 25.11.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 02.12.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 09.12.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 16.12.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Donnerstag 23.12.2021 | 14.15-16.00 Uhr | --, -- |
| Module |
Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach: Informatik) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science) Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science) Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach: Computer Science) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | Oral exam expected Dates: Wednesday, 15 December 2021 and Thursday, 16 December 2021 |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | 1-6 0,5 |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Fachbereich Informatik |