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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms 4 KP

Semester Herbstsemester 2021
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. We will discuss both "classical" topics such as Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees and "modern" approaches based on sophisticated (deep) learning models.
Lernziele This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students get an overview of modern machine learning methods and their applications to bio-medical problems.
Literatur R. Durbin: Biological sequence analysis
Aaron C. Courville, Ian Goodfellow und Yoshua Bengio: Deep Learning
Weblink link to course web page

 

Teilnahmebedingungen Mathematische Methoden I
Mathematische Methoden II
Einführung in die Statistik
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall wöchentlich
Datum 23.09.2021 – 23.12.2021
Zeit Donnerstag, 14.15-16.00 - Online Präsenz -
Datum Zeit Raum
Donnerstag 23.09.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 30.09.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 07.10.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 14.10.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 21.10.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 28.10.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 04.11.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 11.11.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 18.11.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 25.11.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 02.12.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 09.12.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 16.12.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Donnerstag 23.12.2021 14.15-16.00 Uhr --, --
Module Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach Informatik)
Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics)
Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach Computer Science)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Oral exam
expected Dates: Wednesday, 15 December 2021 and Thursday, 16 December 2021
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Fachbereich Informatik

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