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12273-01 - Blockkurs: Microbiology and Immunology 15 KP

Semester Frühjahrsemester 2022
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Marek Basler (marek.basler@unibas.ch)
Dirk Bumann (dirk.bumann@unibas.ch, BeurteilerIn)
Christoph Dehio (christoph.dehio@unibas.ch)
Médéric Diard (mederic.diard@unibas.ch)
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Lukas Jeker (lukas.jeker@unibas.ch)
Urs Jenal (urs.jenal@unibas.ch)
Malcolm G.P. Page (malcolmgp.page@unibas.ch)
Jean Pieters (jean.pieters@unibas.ch)
Inhalt Biological topics in microbiology, molecular genetics and infection biology (5 weeks):
Basic molecular and cellular concepts of
(i) bacterial cell cycle control,
(ii) bacterial differentiation,
(iii) signal transduction and gene regulation in bacteria,
(iv) bacterial heterogeneity,
(v) bacterial pathogenesis and subversion of host cellular functions, with emphasis on type-IV and type-VI secretion systems,
(vi) innate and adaptive immune responses to bacterial infection,
(vii) industrial microbiology,
(viii) evolutionary microbiology.

Technical topics in microbiology, molecular genetics and infection biology:
Sterile technique, light microscopy, bacterial and bacteriophage growth and titration, specific enrichment of bacteria from the environment, genetic manipulations of bacteria (transposon mutagenesis, general recombination, generalized transduction, mapping of mutations, antibiotic selection, conditional mutations), isolation of DNA, agarose-gel electrophoresis, PCR amplification of a gene, cloning of the gene and expression of the product, protein purification and analysis (SDS PAGE), cell culture and infection of cell lines, monitoring of bacterial invasion, monitoring of apoptosis, resistance to the bactericidal activity of complement, construction of bacterial knock-out mutants, bacterial conjugation, DNA microarray analyses, RNA isolation and quantitative RT-PCR analysis, green fluorescent protein and immunofluorescence staining and fluorescence microscopy, bacterial cell cycle synchronization techniques, flow cytometry, metabolic radiolabeling, immune-precipitation and immune-blot analysis, bacterial population dynamics in co-cultures.

Biological topics in immunology (1 week):
(i) The molecular and cellular concepts for the development of the innate and adaptive immune system.
(ii) How does the immune system respond to foreign intruders by discriminating self/non-self.
(iii) How does the immune system protect against viral infection.
(iv) How do pathogens interact with and reprogram immune cells.

Technical topics in immunology:
Identification of major organs of the immune system of mice by immunohistochemistry. Fluorescence activated cell sorting (FACS) for detection of cell types and antigen-specific T lymphocytes. Quantification of antibodies by enzyme linked immune sorbent assay (ELISA) and neutralization assay. Analysis of pathogen-macrophage interaction; Detection of immune activation status by PCR.
Lernziele The course teaches basic laboratory practices and experimental techniques used in modern molecular microbiology, bacterial genetics, bacterial infection biology, and immunology. Accompanying lectures complement the biological and technical themes.
Bemerkungen masks are compulsory for lab
for biology students only
compulsory attendance
Weblink https://adam.unibas.ch

 

Teilnahmebedingungen Successful completion of the basic studies and the first year of the advanced level in the Bachelor of Biology.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Block
Datum 21.02.2022 – 08.04.2022
Zeit Siehe Detailangaben

Block course: 21.02.-08.04.2022

Datum Zeit Raum
Montag 21.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 22.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 23.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 24.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 25.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 28.02.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 01.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 02.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 03.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 04.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 07.03.2022 08.30-18.00 Uhr Fasnachtsferien
Dienstag 08.03.2022 08.30-18.00 Uhr Fasnachtsferien
Mittwoch 09.03.2022 08.30-18.00 Uhr Fasnachtsferien
Donnerstag 10.03.2022 08.30-18.00 Uhr Fasnachtsferien
Freitag 11.03.2022 08.30-18.00 Uhr Fasnachtsferien
Montag 14.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 15.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 16.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 17.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 18.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 21.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 22.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 23.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 24.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 25.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 28.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 29.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 30.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 31.03.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 01.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 04.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 05.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 06.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 07.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 08.04.2022 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Module Modul: Blockkurs (Master Studienfach Biologie)
Vertiefungsrichtungen: Molekularbiologie und Integrative Biologie (Bachelorstudium: Biologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung written exam, 180 minutes
22.04.2022, 13-16h, Neues Biozentrum, U1.131
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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