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| Semester | Herbstsemester 2022 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Richard Neher (richard.neher@unibas.ch) Erik van Nimwegen (erik.vannimwegen@unibas.ch, BeurteilerIn) Mihaela Zavolan (mihaela.zavolan@unibas.ch) |
| Inhalt | New measurement technologies have transformed biology into a data rich science. Quantitative analysis and mathematical models are needed to make sense of these data and reach a better, more predictive understanding of biological systems. Such understanding often depends on identifying how biology is constrained by the laws of physics and how it exploits self-organization principles. In this course, we will review how ideas and concepts from physics have helped understanding biological systems by discussing landmark papers in the field. Topics that will be covered include quantitative laws in genome evolution, regulatory circuits for gene regulation and their specific behaviors, the role of gene expression noise, bacterial growth laws, regulatory principles in metazoan development, and application of maximum entropy and information theory principles to biological problems from protein structure to development. Pre-requisites are a good mathematical background (linear algebra, dynamical systems) as well as a basic background in biology. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: - solid mathematical background - programming skills - biological background - lectures: Computational Biology I and II: desirable |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | Online-Angebot fakultativ |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Montag | 10.15-12.00 | - Online Präsenz - |
| wöchentlich | Montag | 13.15-14.00 | - Online Präsenz - |
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 26.09.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 03.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 03.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 10.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 10.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 17.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 17.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 24.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 24.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 31.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 31.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 07.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 07.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 14.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 14.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 21.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 21.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 28.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 28.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 05.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 05.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 12.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 12.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 19.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 19.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Module |
Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | The overall result (pass/fail) is based on the performance in the exercises. |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |