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| Semester | Herbstsemester 2022 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Richard Neher (richard.neher@unibas.ch) Erik van Nimwegen (erik.vannimwegen@unibas.ch, BeurteilerIn) Mihaela Zavolan (mihaela.zavolan@unibas.ch) |
| Inhalt | New measurement technologies have transformed biology into a data rich science. Quantitative analysis and mathematical models are needed to make sense of these data and reach a better, more predictive understanding of biological systems. Such understanding often depends on identifying how biology is constrained by the laws of physics and how it exploits self-organization principles. In this course, we will review how ideas and concepts from physics have helped understanding biological systems by discussing landmark papers in the field. Topics that will be covered include quantitative laws in genome evolution, regulatory circuits for gene regulation and their specific behaviors, the role of gene expression noise, bacterial growth laws, regulatory principles in metazoan development, and application of maximum entropy and information theory principles to biological problems from protein structure to development. Pre-requisites are a good mathematical background (linear algebra, dynamical systems) as well as a basic background in biology. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: - solid mathematical background - programming skills - biological background - lectures: Computational Biology I and II: desirable |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | Online-Angebot fakultativ |
| Intervall | wöchentlich |
| Datum | 19.09.2022 – 19.12.2022 |
| Zeit |
Montag, 10.15-12.00 Biozentrum, Seminarraum 01.004 Montag, 13.15-14.00 Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 19.09.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 26.09.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 26.09.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 03.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 03.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 10.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 10.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 17.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 17.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 24.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 24.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 31.10.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 31.10.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 07.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 07.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 14.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 14.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 21.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 21.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 28.11.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 28.11.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 05.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 05.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 12.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 12.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 19.12.2022 | 10.15-12.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Montag 19.12.2022 | 13.15-14.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 01.004 |
| Module |
Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | The overall result (pass/fail) is based on the performance in the exercises. |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |