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| Semester | Herbstsemester 2022 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, BeurteilerIn)
Adam Mazur (adam.mazur@unibas.ch) Michael Podvinec (michael.podvinec@unibas.ch) |
| Inhalt | Day 1: Analysis of structural and biophysical data with Python. Numerical Python modules: NumPy, SciPy, Pandas. Data visualization: Matplotlib Day 2: Working with protein structures and sequences: Biopython, OpenStructure and PyMOL Day 3: Practical session, ideally with application to participants' research projects The course will cover the essentials of practical Python programming for structural biology. It is designed for PhD and MSc students who already have basic knowledge in Python programming and would like to learn how to enhance their skills to solve realistic cases in the field of structural biology. The focus will be put on acquiring practical knowledge about Python modules relevant to structural biology, numerical analysis and visualization. The course days consist of an introductory presentation on the basic concepts and best practices, followed by practical exercises, during which participants can apply the acquired skills. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: basic experience in Python programming (e.g. course E7: Programming for Life Sciences 43513). The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded. PhD students only. |
| Anmeldung zur Lehrveranstaltung | Please register via: phd-biozentrum@unibas.ch. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Block |
| Datum | 19.09.2022 – 19.12.2022 |
| Zeit | Siehe Detailangaben |
Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.
| Module |
Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | Detailed information on ADAM workspace. https://adam.unibas.ch/login.php. |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |