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34604-01 - Vorlesung mit Praktikum: Introduction to Protein Interaction Analysis by Affinity Purification - Mass Spectrometry 1 KP

Semester Frühjahrsemester 2023
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Thomas Bock (thomas.bock@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexander Schmidt (alex.schmidt@unibas.ch)
Inhalt 3-day practical course on affinity purification-mass spectrometry (AP-MS). During the course we will look into the methodology used for identification of protein-protein interactions by mass spectrometry. Specifically, we will perform the purification of a target protein and its preparation for mass spectrometry, we will perform the mass spectrometry measurement of the sample, as well as learn how to analyze the resulting AP-MS data.

Day 1: Sample preparation
Seminar: Introduction to AP-MS workflows, advantages/disadvantages of different protein affinity tags/enrichment strategies

Hands-on training: Affinity purification of a target protein out of a cellular lysate, protein digestion over night

Day 2: Mass spectrometry analysis
Seminar: Introduction to mass spectrometry (MS) and its applications in molecular biology

Hands-on training: Solid-phase extraction of peptides, mass spectrometry measurement

Day 3: Data analysis
Seminar: Introduction to MS-data analysis, principles of protein identification, protein-protein interaction data analysis
Bemerkungen Please register via: phd-biozentrum@unibas.ch.
Course dates: 18.4. - 20.4.2023 (3 days)
Weblink Graduate Teaching Program

 

Teilnahmebedingungen The courses are limited to a maximum of 6 participants. PhD students only.
The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Block
Datum 20.02.2023 – 02.06.2023
Zeit Siehe Detailangaben

18.4. - 20.4.2023

Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.

Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung An-/Abmelden: Belegen resp. Stornieren der Belegung via MOnA
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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