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46377-01 - Vorlesung: Molecular Modeling in Drug Design 2 KP

Semester Herbstsemester 2023
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Markus A. Lill (markus.lill@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt This course consists of three different elements:
- Lectures (pre-recorded)
- Theoretical problem solving
- Practical computer labs

The course is provided in a flipped-classroom style. Lectures are pre-recorded. Students are requested to understand lectures before entering the classroom. Short quizzes will be taken at the beginning of the “Theoretical problem solving” sessions. In those sessions problems will also be solved in small groups and selected problems have to be submitted for grades. Practical computer labs will intensify the understanding of the material.

Topics covered by the lectures:
- Virtual screening
- Molecular docking and scoring
- Molecular dynamics simulations
- Free energy calculations
- Descriptors, Fingerprints, QSAR
- Library design
- Neural networks and deep learning
Lernziele Advanced overview of computational and modeling methods in drug design.
In-depth understanding of the state-of-the-art techniques employed in the modern rational drug design, including their strenghts and weaknesses.
Solving theoretical and practical problems in computational drug design.

Literatur Citations for further reading will be provided throughout the course.
Bemerkungen Film and sound recordings during the course are strictly forbidden (recorders may be confiscated
Weblink Department of Pharmaceutical Sciences

 

Teilnahmebedingungen Successfully completed lecture series 12205-01 "Einführung ins Molecular Modeling". Basic experience with molecular modeling software required.
Completed Bachelor degree.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall wöchentlich
Datum 19.09.2023 – 18.01.2024
Zeit Dienstag, 15.15-17.00 Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Datum Zeit Raum
Dienstag 19.09.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 26.09.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 03.10.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 10.10.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 17.10.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 24.10.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 31.10.2023 15.15-17.00 Uhr - Siehe Bemerkung, Examination weeks
Dienstag 07.11.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 14.11.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 21.11.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 28.11.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 05.12.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 12.12.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Dienstag 19.12.2023 15.15-17.00 Uhr Pharmazentrum, Computerraum Cherry
Donnerstag 18.01.2024 09.30-10.30 Uhr Pharmazentrum, Hörsaal 1
Module Modul: General Skills and Experimental Tools (Masterstudium: Drug Sciences)
Modul: Vertiefung Medizinische Nanowissenschaften (Masterstudium: Nanowissenschaften)
Wahlbereich Master Pharmazie: Empfehlungen (Masterstudium: Pharmazie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung 6 Quizzes + Problems to be solved in class or at home
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Pharmazeutische Wissenschaften

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