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| Semester | Herbstsemester 2023 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Richard Neher (richard.neher@unibas.ch) Erik van Nimwegen (erik.vannimwegen@unibas.ch, BeurteilerIn) Mihaela Zavolan (mihaela.zavolan@unibas.ch) |
| Inhalt | New measurement technologies have transformed biology into a data rich science. Quantitative analysis and mathematical models are needed to make sense of these data and reach a better, more predictive understanding of biological systems. Such understanding often depends on identifying how biology is constrained by the laws of physics and how it exploits self-organization principles. In this course, we will review how ideas and concepts from physics have helped understanding biological systems by discussing landmark papers in the field. Topics that will be covered include quantitative laws in genome evolution, regulatory circuits for gene regulation and their specific behaviors, the role of gene expression noise, bacterial growth laws, regulatory principles in metazoan development, and application of maximum entropy and information theory principles to biological problems from protein structure to development. Pre-requisites are a good mathematical background (linear algebra, dynamical systems) as well as a basic background in biology. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmebedingungen | Prerequisites: - solid mathematical background - programming skills - biological background - lectures: Computational Biology I and II: desirable |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | Online-Angebot fakultativ |
| Intervall | wöchentlich |
| Datum | 18.09.2023 – 18.12.2023 |
| Zeit |
Montag, 10.15-12.00 - Online Präsenz - Montag, 13.15-14.00 - Online Präsenz - |
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 18.09.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 18.09.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 25.09.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 25.09.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 02.10.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 02.10.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 09.10.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 09.10.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 16.10.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 16.10.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 23.10.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 23.10.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 30.10.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 30.10.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 06.11.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 06.11.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 13.11.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 13.11.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 20.11.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 20.11.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 27.11.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 27.11.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 04.12.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 04.12.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 11.12.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 11.12.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Montag 18.12.2023 | 10.15-12.00 Uhr | --, -- |
| Montag 18.12.2023 | 13.15-14.00 Uhr | --, -- |
| Module |
Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach Zellbiologie) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Leistungsüberprüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Leistungsüberprüfung | The overall result (grading 1 - 6) is based on the performance in the exercises, the quality of the written report and in at least 80% of attendance of the lecture. |
| An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | 1-6 0,5 |
| Wiederholtes Belegen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |