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34603-01 - Vorlesung mit Praktikum: A Practical Introduction to Biophysical Methods 2 KP

Semester Frühjahrsemester 2024
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Tobias Mühlethaler (t.muehlethaler@unibas.ch)
Timothy Sharpe (timothy.sharpe@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt This course provides a practical and theoretical introduction of a range of biophysical methods that can be used to measure the interactions, stability and size of biomolecules. Students will gain hands-on experience of different techniques, an idea of how those techniques can complement each other, and opportunities to discuss which techniques might be suitable for their own projects.

The techniques covered in the course will be: isothermal titration calorimetry (ITC), microscale thermophoresis (MST), surface plasmon resonance (SPR), differential scanning fluorimetry (DSF), dynamic light scattering (DLS), multi-angle light-scattering (MALS), analytical ultracentrifugation (AUC), and mass photometry.

At the end of the course, students will be required to write a short proposal (2-4 pages) for the application of at least one of the techniques covered in the course to their own research project. The proposal should demonstrate a theoretical understanding of the technique, consideration of the sample requirements and experimental protocol, and ideas about the potential meaning of the results within the context of their project.

Day 1: Overview of methods for biomolecule interactions; Overview of BF resources for users; ITC theory; ITC experiment.
Day 2: MST theory; MST experiment; Overview of other methods for studying binding; discussion of more advanced data analysis (global fitting, error analysis).
Day 3: Overview of stability screening; DSF theory; DSF experiment; DLS theory; DLS experiment
Day 4: Overview of mass and size determination; MALS theory; MALS experiment; Mass Photometry theory and experiment; AUC theory and data analysis.
Bemerkungen Both courses are fully booked! Please do not register anymore!
Weblink Graduate Teaching Program

 

Teilnahmebedingungen The courses are limited to a maximum of 4 participants, PhD students only.
The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
täglich Siehe Einzeltermine
täglich Siehe Einzeltermine

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Montag 18.03.2024 10.00-11.30 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.062
Dienstag 19.03.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Mittwoch 20.03.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Donnerstag 21.03.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Montag 08.04.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Dienstag 09.04.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Mittwoch 10.04.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Donnerstag 11.04.2024 09.30-11.00 Uhr Biozentrum, Sitzungszimmer 02.088
Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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