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45249-01 - Vorlesung mit Übungen: Introduction to Python Programming for Structural & Quantitative Biology and Image Processing 1 KP

Semester Herbstsemester 2024
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Flavio Ackermann (flavio.ackermann@unibas.ch)
Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, BeurteilerIn)
Adam Mazur (adam.mazur@unibas.ch)
Michael Podvinec (michael.podvinec@unibas.ch)
Inhalt The first part of this course is a compact introduction to Python programming without assuming any previous experience. Afterwards, some important scientific aspects of Python programming will be addressed:
* Numerical Python modules: NumPy, SciPy, Pandas.
* Data visualization using Matplotlib
* Working with protein structures and sequences: Biopython and PyMOL
* Image processing with the scikit-image module

The focus will be put on acquiring practical knowledge about Python modules relevant to structural biology, numerical analysis and visualization. The course days consist of an introductory presentation on the basic concepts and best practices, followed by practical exercises, during which participants can apply the acquired skills.
Bemerkungen Course dates: January 27, 28, 29 and 30, 2025
Time: 9:15-17:00

Weblink Graduate Teaching Program

 

Teilnahmebedingungen The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded.MsC and PhD students.
Anmeldung zur Lehrveranstaltung Please register via: phd-biozentrum@unibas.ch.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
Block Siehe Einzeltermine

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Montag 27.01.2025 09.15-18.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Mango 02.081
Dienstag 28.01.2025 09.15-18.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Mango 02.081
Mittwoch 29.01.2025 09.15-18.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Mango 02.081
Donnerstag 30.01.2025 09.15-18.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Mango 02.081
Module Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie)
Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie)
Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik)
Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology)
Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik)
Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie)
Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie)
Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie)
Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie)
Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie)
Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie)
Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung Detailed information on ADAM workspace. https://adam.unibas.ch/login.php.
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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