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68795-01 - Praktikum: Experimental Molecular Biology 12 KP

Semester Herbstsemester 2024
Angebotsmuster Jahreskurs
Dozierende Oliver Biehlmaier (oliver.biehlmaier@unibas.ch)
Dominik Buser (dominik-pascal.buser@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexia Loynton-Ferrand (alexia.ferrand@unibas.ch)
Alexander Schier (alex.schier@unibas.ch)
Inhalt • Media and buffer preparation for Molecular Biology
• Molecular cloning: polymerase chain reaction (PCR), endonuclease/restriction enzyme digestion, agarose gel electrophoresis, ligation, bacterial transformation, DNA plasmid isolation/purification, Sanger sequencing
• Mammalian cell culture: Culturing, splitting, counting and seeding cells, plasmid transfection, protein expression, cell lysis
• Protein analysis: Protein concentration determination, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), Western Blotting, Enhanced chemiluminescence (ECL)
• Light and Fluorescence Microscopy: Basics skills with light microscope, immunofluoresence (IF) staining
• Scientific data illustration
• Image analysis
• Preparation and presentation of collected data
• Reading and understanding literature
• Experimental design
• Troubleshooting
Lernziele Aim of the Experimental Molecular Biology (EMB) course is to train Biology students for the gradual transition from a student to a scientist, including training technical as well as scientific/intellectual skills. By combining these skills, students will dissect the function, localization, and interaction network of a protein of interest.

Technical skills include essential lab skills, starting with pipetting, making buffers, cloning, CRISPR/Cas9, protein expression in mammalian cell culture, standard biochemical techniques, as well as more advanced techniques such as microscopy and proteomics.

Scientific/intellectual skills comprise sharpening student’s mindset in planning and interpreting experiments, as well as reading, presenting, and discussing literature and scientific articles.
Literatur Lectures, protocols, other information, and the agenda will be provided using an internal platform and on ADAM (https://adam.unibas.ch).
Bemerkungen Pregnant and nursing mothers should inform the assessor of the course at least two weeks prior to EMB course start. Students must have an accident insurance. Students requiring adaptive measures due to a handicap or chronic disorder should inform the assessor after registration. The “StoB (Studieren ohne Barrieren)” service center is available for your needs and assistance.
In case of sickness, inform the assessor by mail with a letter of absence including a sick note (attest).

Students are divided into two groups:

Group A: Tuesday-Wednesday, 13:15-18:00
Group B: Thursday-Friday, 13:15-18:00

For introduction into data management and microscopy, we will host Dr. Michael Podvinec and Dr. Oliver Biehlmaier.

All students of Group A and B will meet on September 17, 2024 at 13:15 for the introduction in room 02.073 (Biozentrum).

 

Teilnahmebedingungen Three requirements must be met for admission to the EMB course:

1. The practical course «Allgemeine Chemie» (12222) and «Grundlagen der präparativen organischen Chemie» (10571) must have been attended. The terms of participation and further information for these courses can be found online in the lecture directories.
2. You must have written the exams at least once in three out of six main lectures of module «Biologie 1» and «Biologie 2».
3. You must register for the EMB course in unibas online services no later than August 20, 2024 (https://services.unibas.ch/).
Anmeldung zur Lehrveranstaltung You must register for the EMB course in unibas online services no later than August 20, 2024 (https://services.unibas.ch/).
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
wöchentlich Dienstag 13.15-18.00 Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
wöchentlich Mittwoch 13.15-18.00 Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
wöchentlich Donnerstag 13.15-18.00 Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
wöchentlich Freitag 13.15-18.00 Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Bemerkungen Two afternoons per week (Tuesday and Wednesday or Thursday and Friday).

Rooms and additional information for the first week will be announced by mail prior to EMB course start.

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Dienstag 17.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 18.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 19.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 19.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 20.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 24.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 24.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 25.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 26.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 26.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 27.09.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 01.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 01.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 02.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 03.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 03.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 04.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 08.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 08.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 09.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 10.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 10.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 11.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 15.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 15.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 16.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 17.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 17.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 18.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 22.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 22.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 23.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 24.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 24.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 25.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 29.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 29.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 30.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 31.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 31.10.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 01.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 05.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 05.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 06.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 07.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 07.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 08.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 12.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 12.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 13.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 14.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 14.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 15.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 19.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 19.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 20.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 21.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 21.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 22.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 26.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 26.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 27.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Mittwoch 27.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Donnerstag 28.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 28.11.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 29.11.2024 13.15-18.00 Uhr Dies Academicus
Freitag 29.11.2024 13.15-18.00 Uhr Dies Academicus
Freitag 29.11.2024 13.15-18.00 Uhr Dies Academicus
Dienstag 03.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 03.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 04.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Mittwoch 04.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Donnerstag 05.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 05.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 06.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Freitag 06.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Dienstag 10.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 10.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 11.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Mittwoch 11.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Donnerstag 12.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 12.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 13.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Freitag 13.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Dienstag 17.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Dienstag 17.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Mittwoch 18.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Mittwoch 18.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Donnerstag 19.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Donnerstag 19.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Freitag 20.12.2024 13.15-14.00 Uhr Biozentrum, Hörsaal U1.101
Freitag 20.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029
Freitag 20.12.2024 13.15-18.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 02.073
Module Modul: Computational Biology (Bachelorstudium: Computational Sciences)
Modul: Molekularbiologie (Bachelorstudium: Biologie)
Leistungsüberprüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Leistungsüberprüfung To pass «Experimental Molecular Biology», the following points are required:

• Attendance of class
• Writing and documenting experiments in a lab journal on a weekly basis
• Active participation in the lab and in class
• Preparation and presentation of literature and research seminars
• Leading good laboratory practice
• 45-min exam at the end of the semester (20.12.2024, 13:15-14:00, Ort folgt)
An-/Abmeldung zur Leistungsüberprüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Wiederholtes Belegen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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