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25661-01 - Vorlesung mit Übungen: Current Topics in Biophysics (6 KP)
| Semester | Herbstsemester 2021 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Richard Neher (richard.neher@unibas.ch) Erik van Nimwegen (erik.vannimwegen@unibas.ch, BeurteilerIn) Mihaela Zavolan (mihaela.zavolan@unibas.ch) |
| Inhalt | New measurement technologies have transformed biology into a data rich science. Quantitative analysis and mathematical models are needed to make sense of these data and reach a better, more predictive understanding of biological systems. Such understanding often depends on identifying how biology is constrained by the laws of physics and how it exploits self-organization principles. In this course, we will review how ideas and concepts from physics have helped understanding biological systems by discussing landmark papers in the field. Topics that will be covered include quantitative laws in genome evolution, regulatory circuits for gene regulation and their specific behaviors, the role of gene expression noise, bacterial growth laws, regulatory principles in metazoan development, and application of maximum entropy and information theory principles to biological problems from protein structure to development. Pre-requisites are a good mathematical background (linear algebra, dynamical systems) as well as a basic background in biology. |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmevoraussetzungen | Prerequisites: - solid mathematical background - programming skills - biological background - lectures: Computational Biology I and II: desirable |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | Online-Angebot fakultativ |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Montag | 10.15-12.00 | - Online Präsenz - |
| wöchentlich | Montag | 13.00-14.00 | - Online Präsenz - |
Einzeltermine
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 27.09.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 27.09.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 04.10.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 04.10.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 11.10.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 11.10.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 18.10.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 18.10.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 25.10.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 25.10.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 01.11.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 01.11.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 08.11.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 08.11.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 15.11.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 15.11.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 22.11.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 22.11.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 29.11.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 29.11.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 06.12.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 06.12.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 13.12.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 13.12.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 20.12.2021 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 20.12.2021 | 13.00-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Module |
Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | The overall result (pass/fail) is based on the performance in the exercises. |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |