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67161-01 - Vorlesung mit Übungen: Artificial Intelligence in Drug Discovery (1 KP)

Semester Frühjahrsemester 2023
Angebotsmuster Jedes Frühjahrsem.
Dozierende Amr Abdallah (amr.abdallah@unibas.ch)
Markus A. Lill (markus.lill@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt This course focuses on new developments in artificial intelligence, in particular deep neural networks, for drug design applications. It consists of
- Lectures (pre-recorded)
- Practical computer labs

The course is provided in a flipped-classroom style. Lectures are pre-recorded. Students are requested to understand lectures before entering the classroom. Short quizzes will be taken at the beginning of the “Computer lab” sessions. In those sessions practcal in silico problems will be solved with the aim to intensify the understanding of the course material.

Topics covered by the lectures:
- De novo design and generative models
- Molecular docking
- Virtual screening
- Free energy calculations
Lernziele In-depth understanding of the state-of-the-art AI techniques employed in the modern rational drug design, including their strenghts and weaknesses.
Solving practical programming problems in AI related to computational drug design.
Literatur Citations for further reading will be provided throughout the course.
Weblink Department of Pharmaceutical Sciences

 

Teilnahmevoraussetzungen - Python programming
- Attended lecture series in 46377: Molecular Modeling in Drug Design or comparable courses (e.g. Computational Chemistry)
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
wöchentlich Freitag 15.15-17.00 Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Freitag 24.02.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Freitag 03.03.2023 15.15-17.00 Uhr Fasnachstferien
Freitag 10.03.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Freitag 17.03.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Freitag 24.03.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Freitag 31.03.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Freitag 07.04.2023 15.15-17.00 Uhr Ostern
Freitag 14.04.2023 15.15-17.00 Uhr Biozentrum, Computerraum Kiwi 02.067
Module Wahlbereich Master Drug Sciences: Empfehlungen (Masterstudium: Drug Sciences)
Prüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Prüfung Short quizzes & practical computer labs
An-/Abmeldung zur Prüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala Pass / Fail
Belegen bei Nichtbestehen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Pharmazeutische Wissenschaften

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