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45401-01 - Vorlesung: Bioinformatics Algorithms (4 KP)

Semester Herbstsemester 2024
Weitere Semesterveranstaltungen zu diesen KP 45401-01 (Vorlesung)
45401-02 (Übung)
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Volker Roth (volker.roth@unibas.ch, BeurteilerIn)
Inhalt In this lecture, an introduction into main bioinformatics algorithms is provided. We will discuss both "classical" topics such as Hidden Markov Models, Markov chains, phylogenetic trees and "modern" approaches based on sophisticated (deep) learning models.
Lernziele This lecture provides an introduction into algorithms and concepts that are important in computational biology / bioinformatics. Students can understand the main algorithmic design principles for problems like sequence alignment, motif finding and phylogenetic inference. Further, students get an overview of modern machine learning methods and their applications to bio-medical problems.
Literatur R. Durbin: Biological sequence analysis
Aaron C. Courville, Ian Goodfellow und Yoshua Bengio: Deep Learning
Weblink link to course web page

 

Teilnahmevoraussetzungen Mathematische Methoden I
Mathematische Methoden II
Einführung in die Statistik
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz
HörerInnen willkommen

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
wöchentlich Donnerstag 14.15-16.00 Biozentrum, Seminarraum U1.197

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Donnerstag 19.09.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 26.09.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum 01.006
Donnerstag 03.10.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 10.10.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 17.10.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 24.10.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 31.10.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 07.11.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 14.11.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 21.11.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 28.11.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 05.12.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 12.12.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Donnerstag 19.12.2024 14.15-16.00 Uhr Biozentrum, Seminarraum U1.197
Module Doktorat Informatik: Empfehlungen (Promotionsfach: Informatik)
Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics)
Modul: Applications of Distributed Systems (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Applications of Machine Intelligence (Masterstudium: Computer Science)
Modul: Concepts of Machine Intelligence (Master Studienfach: Computer Science)
Modul: Electives in Data Science (Masterstudium: Data Science)
Modul: Foundations in Physics of Life (Masterstudium: Physics of Life)
Modul: Machine Learning Foundations (Masterstudium: Data Science)
Prüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Prüfung Oral exam: in order to participate, you need to hand in at least 70% of all exercise sheets.
Expected dates: January 15/16, 2025. Room 00.003, Spiegelgasse 1 and room 05.13, Spiegelgasse 1.
An-/Abmeldung zur Prüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Belegen bei Nichtbestehen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Fachbereich Informatik

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