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12273-01 - Blockkurs: Microbiology and Immunology (15 KP)

Semester Herbstsemester 2024
Angebotsmuster Jedes Herbstsemester
Dozierende Marek Basler (marek.basler@unibas.ch)
Dirk Bumann (dirk.bumann@unibas.ch, BeurteilerIn)
Christoph Dehio (christoph.dehio@unibas.ch)
Médéric Diard (mederic.diard@unibas.ch)
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Urs Jenal (urs.jenal@unibas.ch)
Carolyn King (carolyn.king@unibas.ch)
Jean Pieters (jean.pieters@unibas.ch)
Daniel Pinschewer (daniel.pinschewer@unibas.ch)
Inhalt Biological topics in microbiology, molecular genetics and infection biology (5 weeks):
Basic molecular and cellular concepts of
(i) bacterial cell cycle control,
(ii) bacterial differentiation,
(iii) signal transduction and gene regulation in bacteria,
(iv) bacterial heterogeneity,
(v) bacterial pathogenesis and subversion of host cellular functions, with emphasis on type-IV and type-VI secretion systems,
(vi) innate and adaptive immune responses to bacterial infection,
(vii) industrial microbiology,
(viii) evolutionary microbiology.

Technical topics in microbiology, molecular genetics and infection biology:
Sterile technique, light microscopy, bacterial and bacteriophage growth and titration, specific enrichment of bacteria from the environment, genetic manipulations of bacteria (transposon mutagenesis, general recombination, generalized transduction, mapping of mutations, antibiotic selection, conditional mutations), isolation of DNA, agarose-gel electrophoresis, PCR amplification of a gene, cloning of the gene and expression of the product, protein purification and analysis (SDS PAGE), cell culture and infection of cell lines, monitoring of bacterial invasion, monitoring of apoptosis, resistance to the bactericidal activity of complement, construction of bacterial knock-out mutants, bacterial conjugation, DNA microarray analyses, RNA isolation and quantitative RT-PCR analysis, green fluorescent protein and immunofluorescence staining and fluorescence microscopy, bacterial cell cycle synchronization techniques, flow cytometry, metabolic radiolabeling, immune-precipitation and immune-blot analysis, bacterial population dynamics in co-cultures.

Biological topics in immunology (1 week):
(i) The molecular and cellular concepts for the development of the innate and adaptive immune system.
(ii) How does the immune system respond to foreign intruders by discriminating self/non-self.
(iii) How does the immune system protect against viral infection.
(iv) How do pathogens interact with and reprogram immune cells.

Technical topics in immunology:
Identification of major organs of the immune system of mice by immunohistochemistry. Fluorescence activated cell sorting (FACS) for detection of cell types and antigen-specific T lymphocytes. Quantification of antibodies by enzyme linked immune sorbent assay (ELISA) and neutralization assay. Analysis of pathogen-macrophage interaction; Detection of immune activation status by PCR.
Lernziele The course teaches basic laboratory practices and experimental techniques used in modern molecular microbiology, bacterial genetics, bacterial infection biology, and immunology. Accompanying lectures complement the biological and technical themes.
Bemerkungen for biology students only
compulsory attendance
Weblink https://adam.unibas.ch

 

Teilnahmevoraussetzungen Successful completion of the basic studies and the first year of the advanced level in the Bachelor of Biology.
Unterrichtssprache Englisch
Einsatz digitaler Medien kein spezifischer Einsatz

 

Intervall Wochentag Zeit Raum
Block Siehe Einzeltermine
Bemerkungen Block course: 11.11.-20.12.2024

Einzeltermine

Datum Zeit Raum
Montag 11.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 12.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 13.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 14.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 15.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 18.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 19.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 20.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 21.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 22.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 25.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 26.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 27.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 28.11.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 29.11.2024 08.30-18.00 Uhr Dies Academicus
Freitag 29.11.2024 08.30-18.00 Uhr Dies Academicus
Montag 02.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 03.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 04.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 05.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 06.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Samstag 07.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Sonntag 08.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 09.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 10.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 11.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 12.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 13.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Samstag 14.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Sonntag 15.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Montag 16.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Dienstag 17.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Mittwoch 18.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Donnerstag 19.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Freitag 20.12.2024 08.30-18.00 Uhr Biozentrum, Praktikum Vorlesungsraum 02.001
Module Modul: Blockkurs (Master Studienfach: Biologie)
Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Bachelorstudium: Biologie)
Vertiefungsrichtungen: Molekularbiologie und Integrative Biologie (Bachelorstudium: Biologie (Studienbeginn vor 01.08.2022))
Prüfung Lehrveranst.-begleitend
Hinweise zur Prüfung written exam, 180 minutes
16.01.2025, 9-12 Uhr, Biozentrum, Hörsaal U1.131
An-/Abmeldung zur Prüfung Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren
Wiederholungsprüfung keine Wiederholungsprüfung
Skala 1-6 0,5
Belegen bei Nichtbestehen beliebig wiederholbar
Zuständige Fakultät Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch
Anbietende Organisationseinheit Departement Biozentrum

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