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34604-01 - Vorlesung mit Praktikum: Introduction to Protein Interaction Analysis by Affinity Purification - Mass Spectrometry (1 KP)
| Semester | Frühjahrsemester 2025 |
| Angebotsmuster | Jedes Semester |
| Dozierende |
Thomas Bock (thomas.bock@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexander Schmidt (alex.schmidt@unibas.ch) |
| Inhalt | 3-day practical course on affinity purification-mass spectrometry (AP-MS). During the course we will look into the methodology used for identification of protein-protein interactions by mass spectrometry. Specifically, we will perform the purification of a target protein and its preparation for mass spectrometry, we will perform the mass spectrometry measurement of the sample, as well as learn how to analyze the resulting AP-MS data. Day 1: Sample preparation Seminar: Introduction to AP-MS workflows, advantages/disadvantages of different protein affinity tags/enrichment strategies Hands-on training: Affinity purification of a target protein out of a cellular lysate, protein digestion over night Day 2: Mass spectrometry analysis Seminar: Introduction to mass spectrometry (MS) and its applications in molecular biology Hands-on training: Solid-phase extraction of peptides, mass spectrometry measurement Day 3: Data analysis Seminar: Introduction to MS-data analysis, principles of protein identification, protein-protein interaction data analysis |
| Bemerkungen | Please register via: phd-biozentrum@unibas.ch. Course dates: will be published soon! |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmevoraussetzungen | The courses are limited to a maximum of 6 participants. PhD students only. The course must be fully attended, otherwise the CPs can not be awarded. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|
Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.
| Module |
Cycle I: Practical and Experimental Skills (Masterstudium: Molekularbiologie) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |