Zurück zur Auswahl
25661-01 - Vorlesung mit Übungen: Current Topics in Biophysics (6 KP)
| Semester | Herbstsemester 2025 |
| Angebotsmuster | Jedes Herbstsemester |
| Dozierende |
Knut Drescher (knut.drescher@unibas.ch)
Richard Neher (richard.neher@unibas.ch) Erik van Nimwegen (erik.vannimwegen@unibas.ch, BeurteilerIn) Mihaela Zavolan (mihaela.zavolan@unibas.ch) |
| Inhalt | New measurement technologies have transformed biology into a data rich science. Quantitative analysis and mathematical models are needed to make sense of these data and reach a better, more predictive understanding of biological systems. Such understanding often depends on identifying how biology is constrained by the laws of physics and how it exploits self-organization principles. In this course, we will review how ideas and concepts from physics have helped understanding biological systems by discussing landmark papers in the field. Topics that will be covered include quantitative laws in genome evolution, trade-offs between unicellular and multicellular organization, regulatory circuits for gene regulation and their specific behaviors, the role of gene expression noise, bacterial growth laws, regulatory principles in metazoan development, and the application of maximum entropy and information theory principles to biological problems from protein structure to development. Pre-requisites are a good mathematical background (calculus, linear algebra, dynamical systems, probability theory) as well as a basic background in biology. |
| Bemerkungen | This course is also part of the MSc program Computational Biology and Bioinformatics with ETH-Z and Uni Zürich. Students from this program should register early and get in touch with the study coordinator to ensure that they have access to the relevant online resources from the start. The course starts in the second week of the semester on 23.9.2024 |
| Weblink | Graduate Teaching Program |
| Teilnahmevoraussetzungen | Prerequisites: - solid mathematical background - lectures: Computational Biology I and II: desirable (for students with unibas background) |
| Unterrichtssprache | Deutsch |
| Einsatz digitaler Medien | Online-Angebot fakultativ |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Montag | 10.15-12.00 | - Online Präsenz - |
| wöchentlich | Montag | 13.15-14.00 | - Online Präsenz - |
Einzeltermine
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Montag 15.09.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 22.09.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 22.09.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 29.09.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 29.09.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 06.10.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 06.10.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 13.10.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 13.10.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 20.10.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 20.10.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 27.10.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 27.10.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 03.11.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 03.11.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 10.11.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 10.11.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 17.11.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 17.11.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 24.11.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 24.11.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 01.12.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 01.12.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 08.12.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 08.12.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 15.12.2025 | 10.15-12.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Montag 15.12.2025 | 13.15-14.00 Uhr | - Online Präsenz -, -- |
| Module |
Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie (Studienbeginn vor 01.08.2025)) Doktorat Biochemie: Empfehlungen (Promotionsfach: Biochemie) Doktorat Biophysik: Empfehlungen (Promotionsfach: Biophysik) Doktorat Computational Biology: Empfehlungen (Promotionsfach: Computational Biology) Doktorat Genetik: Empfehlungen (Promotionsfach: Genetik) Doktorat Mikrobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Mikrobiologie) Doktorat Molekularbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Molekularbiologie) Doktorat Neurobiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Neurobiologie) Doktorat Pharmakologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Pharmakologie) Doktorat Strukturbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Strukturbiologie) Doktorat Zellbiologie: Empfehlungen (Promotionsfach: Zellbiologie) Kernfächer und Seminar (Masterstudium: Computational Biology and Bioinformatics) Modul: Cycle E: Computational and Systems Biology (Masterstudium: Molekularbiologie) Modul: Foundations in Physics of Life (Masterstudium: Physics of Life) Modul: Vertiefung Molekularbiologie (Masterstudium: Nanowissenschaften) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | To pass the course, students need to participate in at least 10 sessions. The grade will be based on quality and quantity of active oral participation, submitted written notes as preparation for each of the sessions, and a report on one of the topics. |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | 1-6 0,5 |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |