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68795-01 - Praktikum: Experimental Molecular Biology (12 KP)
| Semester | Herbstsemester 2025 |
| Angebotsmuster | Jahreskurs, beginnt im Herbstsemester |
| Dozierende |
Oliver Biehlmaier (oliver.biehlmaier@unibas.ch)
Dominik Buser (dominik-pascal.buser@unibas.ch, BeurteilerIn) Alexia Loynton-Ferrand (alexia.ferrand@unibas.ch) Alexander Schier (alex.schier@unibas.ch) |
| Inhalt | • Media and buffer preparation for Molecular Biology • Molecular cloning: polymerase chain reaction (PCR), endonuclease/restriction enzyme digestion, agarose gel electrophoresis, ligation, bacterial transformation, recombinant gene engineering, DNA plasmid isolation/purification, Sanger sequencing • Mammalian cell culture: Culturing, splitting, counting and seeding cells, plasmid transfection, protein expression, cell lysis • Protein analysis: Protein concentration determination, sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE), Western Blotting, Enhanced chemiluminescence (ECL) • Light and Fluorescence Microscopy: Basics skills with light microscope, immunofluoresence (IF) staining • Scientific data illustration • Image analysis • Preparation and presentation of collected data • Reading and understanding literature • Experimental design • Troubleshooting |
| Lernziele | Aim of the Experimental Molecular Biology (EMB) course is to train Biology students for the gradual transition from a student to a scientist, including training technical as well as scientific/intellectual skills. By combining these skills, students will dissect the function, localization, and interaction network of a protein of interest. Technical skills include essential lab skills, starting with pipetting, making buffers, cloning, CRISPR/Cas9, protein expression in mammalian cell culture, standard biochemical techniques, as well as more advanced techniques such as microscopy and proteomics. Scientific/intellectual skills comprise sharpening student’s mindset in planning and interpreting experiments, as well as reading, presenting, and discussing literature and scientific articles. |
| Literatur | Lectures, protocols, other information, and the agenda will be provided using an internal platform and on ADAM (https://adam.unibas.ch). |
| Bemerkungen | Pregnant and nursing mothers should inform the assessor of the course at least two weeks prior to EMB course start. Students must have an accident insurance. Students requiring adaptive measures due to a handicap or chronic disorder should inform the assessor after registration. The “StoB (Studieren ohne Barrieren)” service center is available for your needs and assistance. In case of sickness, inform the assessor by mail with a letter of absence including a sick note (attest). Students are divided into two groups (group assignment will be communicated beginning of September): Group A: Tuesday-Wednesday, 13:15-18:00 Group B: Thursday-Friday, 13:15-18:00 After the first semester (HS2025) – in the transition to the next semester (FS2026) – there will be a rotation of the group students, i.e., students from Group B have the right to transition to Group A, while students from Group A will transition to Group B. Nevertheless, students having attended the EMB course in HS2025 in Group B can also remain in the Group B in FS2026. All students of Group A and B will meet on September 16, 2025 at 13:15 for a general course introduction (02.073). For introduction into data management, we will host Dr. Michael Podvinec. For the introduction into microscopy, Dr. Oliver Biehlmaier and the Imaging Core Facility (IMCF) will run parts of the course as follows: • Introduction to microscopy and theory (teaching week for Group A and B): (25.11.2025) (Tuesday) and (27.11.2025) (Thursday) • Practical weeks from December 2-12, 2025 (lab weeks for Group A and B will be announced on our internal platform) |
| Teilnahmevoraussetzungen | Three requirements must be met for admission to the EMB course: 1. The practical course «Allgemeine Chemie» (12222) and «Grundlagen der präparativen organischen Chemie» (10571) must have been attended. The terms of participation and further information for these courses can be found online in the lecture directories. 2. You must have written the exams at least once in three out of six main lectures of module «Biologie 1» and «Biologie 2». 3. You must register for the EMB course in unibas online services no later than August 20, 2025 (https://services.unibas.ch/). |
| Anmeldung zur Lehrveranstaltung | You must register for the EMB course in unibas online services no later than August 20, 2025 (https://services.unibas.ch/). 68795-01 is meant for registration by Biology students. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Dienstag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Mittwoch | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Donnerstag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Freitag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Bemerkungen |
Two afternoons per week (Tuesday and Wednesday or Thursday and Friday). Rooms and additional information for the first week will be announced by mail prior to EMB course start. |
Einzeltermine
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Dienstag 16.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 16.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 17.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 17.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 18.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 18.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 19.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 19.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 23.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 23.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 24.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 24.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 25.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 25.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 26.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 26.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 30.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 30.09.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 01.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 01.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 02.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 02.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 03.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 03.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 07.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 07.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 08.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 08.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 09.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 09.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 10.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 10.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 14.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 14.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 15.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 15.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 16.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 16.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 17.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 17.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 21.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 21.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 22.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 22.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 23.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 23.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 24.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 24.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 28.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 28.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 29.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 29.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 30.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 30.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 31.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 31.10.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 04.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 04.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 05.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 05.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 06.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 06.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 07.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 07.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 11.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 11.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 12.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 12.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 13.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 13.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 14.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 14.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 18.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 18.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 19.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 19.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 20.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 20.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 21.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 21.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 25.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 25.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 26.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 26.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 27.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 27.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 28.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Dies Academicus |
| Freitag 28.11.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Dies Academicus |
| Dienstag 02.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 02.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 03.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 03.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 04.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 04.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 05.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 05.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 09.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 09.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 10.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 10.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 11.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 11.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 12.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 12.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Dienstag 16.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 16.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Mittwoch 17.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 17.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Donnerstag 18.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 18.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Freitag 19.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 19.12.2025 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Seminarraum 02.073 |
| Module |
Modul: Computational Biology (Bachelorstudium: Computational Sciences) Modul: Molekularbiologie (Bachelorstudium: Biologie) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | To pass «Experimental Molecular Biology», the following points are required: • Attendance of class • Writing and documenting experiments in a lab journal on a weekly basis • Active participation in the lab and in class • Preparation and presentation of literature and research seminars • Leading good laboratory practice • 45-min exam at the end of the semester (19.12.2025, 13:15-14:00, Ort folgt) |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |