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68795-02 - Praktikum: Experimental Molecular Biology (12 KP)
| Semester | Frühjahrsemester 2026 |
| Angebotsmuster | Jahreskurs, beginnt im Herbstsemester |
| Dozierende |
Dominik Buser (dominik-pascal.buser@unibas.ch, BeurteilerIn)
Alexander Schier (alex.schier@unibas.ch) |
| Inhalt | • Repetition of acquired skills in "Experimental Molecular Biology (68795-01)" • Bacterial protein expression: IPTG induction and IMAC • Molecular cloning: CRISPR/DNA plasmid isolation/purification and Sanger sequencing • Mammalian cell culture: Culturing; Splitting; Counting and Seeding cells; Plasmid transfection; Protein expression; Cell lysis • Protein analysis: Protein concentration determination; Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE); Western Blotting; Enhanced chemiluminescence (ECL); Coomassie staining • AP-MS/Proteomics: Theory and practice of mass spectrometry and proteomics; Pulldown with streptavidin beads; Reduction and tryptic digestion; Peptide purification and desalting; Preparation of samples for MS loading • Preparation and presentation of collected data • Reading, presenting, and understanding scientific articles • Experimental design • Troubleshooting |
| Lernziele | Aim of the "Experimental Molecular Biology (EMB)" course is to train Biology students for the gradual transition from a student to a scientist, including training technical as well as scientific/intellectual skills. By combining these skills, students will dissect the function, localization, and interaction network of a protein of interest. Technical skills include essential lab skills, starting with pipetting, making buffers, cloning, protein expression in mammalian cell culture, standard biochemical techniques, as well as more advanced techniques such as microscopy and proteomics. Scientific/intellectual skills comprise sharpening student’s mindset in planning and interpreting experiments, as well as reading, presenting, and discussing literature and scientific articles. |
| Literatur | Lectures, protocols, other information, and the agenda will be provided using an internal platform and on ADAM (https://adam.unibas.ch). |
| Bemerkungen | Pregnant and nursing mothers should inform the assessor of the course at least two weeks prior to EMB course start. Students must have an accident insurance. Students requiring adaptive measures due to a handicap or chronic disorder should inform the assessor after registration. The “StoB (Studieren ohne Barrieren)” service center is available for your needs and assistance. In case of sickness, inform the assessor by mail with a letter of absence including a sick note (attest). For introduction into proteomics, we will host Dr. Alex Schmidt and the Proteomics Core Facility. In addition, for a literature search seminar, we will host PD Dr. Christian Appenzeller-Herzog and Dr. Nuria Plattner. During the weeks with the Proteomics Core Facility, there will be irregular plan during Week 12-14. The exact plan will be communicated the first day of your class in FS2026. |
| Teilnahmevoraussetzungen | This course can be only attended if the "Experimental Molecular Biology (68795-01)" was completed (during fall semesters). |
| Anmeldung zur Lehrveranstaltung | EMB course (68795-02) can be only attended if the former course (68795-01) has been completed. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Dienstag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Mittwoch | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Donnerstag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| wöchentlich | Freitag | 13.15-18.00 | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Bemerkungen |
Two afternoons per week (Tuesday and Wednesday or Thursday and Friday). Rooms and additional information will be announced on our internal course website. |
Einzeltermine
| Datum | Zeit | Raum |
|---|---|---|
| Dienstag 17.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 18.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 19.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 20.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 24.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Dienstag 24.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Mittwoch 25.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Mittwoch 25.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Donnerstag 26.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Donnerstag 26.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Freitag 27.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Freitag 27.02.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Fasnachtswoche |
| Dienstag 03.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 04.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 05.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 06.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 10.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | --, -- |
| Dienstag 10.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 11.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 12.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 13.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 17.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 18.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | --, -- |
| Mittwoch 18.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 19.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 20.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 24.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 25.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 26.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 27.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 31.03.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 01.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 02.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Osterwoche |
| Donnerstag 02.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Osterwoche |
| Freitag 03.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Osterwoche |
| Freitag 03.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Osterwoche |
| Dienstag 07.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 08.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 09.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 10.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 14.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 15.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | --, -- |
| Mittwoch 15.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 16.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 17.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 21.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 22.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 23.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 24.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 28.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 29.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 30.04.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 01.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Tag der Arbeit |
| Freitag 01.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Tag der Arbeit |
| Dienstag 05.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 06.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 07.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 08.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 12.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 13.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 14.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Auffahrt |
| Donnerstag 14.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Auffahrt |
| Freitag 15.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Auffahrt |
| Freitag 15.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Auffahrt |
| Dienstag 19.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 20.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 21.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 22.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Dienstag 26.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Mittwoch 27.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Donnerstag 28.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Freitag 29.05.2026 | 13.15-18.00 Uhr | Biozentrum, Praktikumslabor klein 02.029 |
| Module |
Modul: Computational Biology (Bachelorstudium: Computational Sciences) Modul: Molekularbiologie (Bachelorstudium: Biologie) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | To pass "Experimental Molecular Biology (68795-02)", the following points are required: • Attendance of class • Writing and documenting experiments in a lab journal on a defined basis • Active participation in the lab and in class • Preparation and presentation of literature (Journal Club) and research seminars • Leading good laboratory practice "Experimental Molecular Biology (68795-02)" can be only attended after completion of "Experimental Molecular Biology (68795-01)". |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anm.: Belegen Lehrveranstaltung; Abm.: stornieren |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |