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13710-01 - Vorlesung: F7: Protein Structure Bioinformatics (2 KP)
| Semester | Frühjahrsemester 2008 |
| Angebotsmuster | unregelmässig |
| Dozierende |
Markus Meuwly (m.meuwly@unibas.ch)
Torsten Schwede (torsten.schwede@unibas.ch, BeurteilerIn) |
| Inhalt | Three-dimensional protein structures are key to a detailed understanding of the molecular basis of protein function, to develop rational strategies for experiments such as site directed mutagenesis, studies of disease related mutations, or the development of specific inhibitors. The course will cover modeling and simulation methods applied to protein structures and their interactions with other molecules: protein structure comparison and classification, protein modeling techniques, molecular mechanics simulations, in silico and structure based drug design. |
| Lernziele | Overview of current methods in computational methods in structural biology, e.g. protein and nucleic acid structure modeling, analysis of structure-function relationships, evolution of protein structures, molecular dynamics simulations and key methods in drug discovery. |
| Literatur | "Computational Structural Biology: Methods and Applications" (2008) World Scientific Publishing. |
| Bemerkungen | Die Veranstaltung besteht aus einer Reihe einführender Vorlesungen (wöchentlich), sowie einem zweitägigen Symposium "Computational Structural Biology" am 13. und 14. März (jeweils ganztägig). |
| Teilnahmevoraussetzungen | Grundkenntnisse in Strukturbiologie (Strukturen und physikalisch-chemische Eigenschaften der Aminosäuren, Peptide und Proteine, Bauprinzipien von Proteinstrukturen) und Grundlagen in der Bioinformatik (Sequenzvergleiche und Alignements, Evolution) sind notwendig. Programmierkenntnisse sind nicht erforderlich. |
| Unterrichtssprache | Englisch |
| Einsatz digitaler Medien | kein spezifischer Einsatz |
| Intervall | Wochentag | Zeit | Raum |
|---|
Keine Einzeltermine verfügbar, bitte informieren Sie sich direkt bei den Dozierenden.
| Module |
Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Biochemie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Biophysik) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Genetik) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Mikrobiologie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Zellbiologie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Pharmakologie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Neurobiologie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Bioinformatik) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Promotionsfach: Strukturbiologie) Cycle F: Genomics and Bioinformatics (Master Molekularbiologie) |
| Prüfung | Lehrveranst.-begleitend |
| Hinweise zur Prüfung | Die Leistungsüberprüfung erfolgt in Form eines Seminarvortrags. Themen und Termine werden zu Beginn der Veranstaltung bekanntgegeben. |
| An-/Abmeldung zur Prüfung | Anmelden: Belegen; Abmelden: Dozierende |
| Wiederholungsprüfung | keine Wiederholungsprüfung |
| Skala | Pass / Fail |
| Belegen bei Nichtbestehen | beliebig wiederholbar |
| Zuständige Fakultät | Philosophisch-Naturwissenschaftliche Fakultät, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Anbietende Organisationseinheit | Departement Biozentrum |