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| Semester | spring semester 2018 |
| Course frequency | Every spring sem. |
| Lecturers |
Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, Assessor)
Tilman Schirmer (tilman.schirmer@unibas.ch) |
| Content | Programm: 1. Introduction (TM & TS); anatomy of a protein, structure determination methods, molecular graphics (TS) 2. From polypeptide to structure: interactions, folds, homology (TS) 3. Structure/function relationships: proteases, kinase, phosphotases (TS) 4. Conformational changes: allosteric control, molecular symmetry, signal transduction (TS) 5. Filaments and aggregates: cytoskeleton, prions, amyloids (TS) 6. Molecular motors (TS) 7. Membranes and membrane proteins: transporters and channels, receptors (TM) 8. DNA structure and replication, RNA biosynthesis and nucleocytoplasmic transport (TM) 9. The ribosome, protein biosynthesis, chaperones, quality control & degradation (TM) 10. Bioenergetics: Mitochondrian ATP synthesis and Photosynthesis (TM) 11. Biosynthetic networks and complexes, multienzymes and assembly lines (TM) 12. Metabolic regulation: Sensors, signalling modules and cascades and the TOR complexes (TM) 13. Questions & Answers, test exam in subgroups (TM & TS) |
| Learning objectives | Folgende Fragen sollten am Ende des Kurses u.a. beantwortet werden können: Welche molekularen Wechselwirkungen bewirken Strukturbildung, welche wiederkehrenden Strukturmuster gibt es, inwieweit ist strukturelle Flexibilität wichtig, wie werden biologische Strukturen bestimmt, wozu werden strukturelle Erkenntnisse eingesetzt, wie können Strukturen vorhergesagt werden? Des weiteren werden die ZuhörerInnen mit ausgewählten Beispielen zu Struktur - Funktionsbeziehungen vertraut gemacht. |
| Bibliography | Vortragsmaterialien werden elektronisch zur Verfügung gestellt. Generelle Biochemie und Zellbiologie Lehrbücher können zur Vor- und Nachbearbeitung herangezogen werden: Textbook Of Structural Biology, Anders Liljas, Lars Liljas, Jure Piskur, Göran Lindblom, Poul Nissen, Morten Kjeldgaard (ISBN 978-9812772084) Lehninger Principles of Biochemistry, 7th Edition, David L. Nelson, Michael M. Cox (ISBN 978-1319108243) Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level, 5th Edition, Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte W. Pratt (ISBN 978-1-118-91846-3) Detaillierte Angaben, auch zu Originalliteratur, erfolgen in den Vorlesungen. Elektronische Feedback-Möglichkeit via Mobilgerät auf www.movo.ch |
| Weblink | https://adam.unibas.ch |
| Language of instruction | English |
| Use of digital media | No specific media used |
| Course auditors welcome |
| Interval | Weekday | Time | Room |
|---|
No dates available. Please contact the lecturer.
| Modules |
Modul Biologie 4 (Bachelor's degree subject: Biology) (Pflicht) Modul Life Sciences (Bachelor Computer Science (Start of studies before 01.08.2010)) Module Basics in Life Sciences (Computational Chemistry) (Bachelor Computational Sciences) Module Basics in Life Sciences (Computational Mathematics) (Bachelor Computational Sciences) Module Biology 4 (Bachelor Biology (Start of studies before 01.08.2013)) (Pflicht) Module Molecular Basis of Biology (Bachelor Computational Sciences) Module Molecular Biology (Bachelor Nanosciences) (Pflicht) Module Sciences (Bachelor Computer Science (Start of studies before 01.08.2016)) Module Specialisation: Computer Science of Life Science (Bachelor Computer Science (Start of studies before 01.08.2016)) Module: Biology 4 (Bachelor Biology) (Pflicht) Vertiefungsmodul Bioinformatik (Bachelor Computer Science (Start of studies before 01.08.2010)) (Pflicht) |
| Assessment format | main lecture exam |
| Assessment details | Anmeldefrist, Zeitpunkt und weitere Informationen zu den Examen werden auf https://philnat.unibas.ch/de/examen veröffentlicht. (Prov. Examenstermine siehe http://bio.unibas.ch/pruefungen/examen/) Dauer der Prüfung: 45 Min. Form der Prüfung: Gemischte Multiple Choice/Freitext-Prüfung, wird unter Zuhilfenahme von EvaExam ausgewertet. Erlaubte Hilfsmittel: Keine Inhalt der Prüfung: Stoff der Vorlesung, Materialien gemäss Vorlesung. Die Benotung erfolgt gemäss Prüfung. Für erfolgreiche Übungsteilnehmer wird die Prüfungsnote 3.5 auf 4 aufgewertet. |
| Assessment registration/deregistration | Reg.: in 'course reg.'; dereg.: Dean of Std. Off. in writing |
| Repeat examination | one repetition, best attempt counts |
| Scale | 1-6 0,5 |
| Repeated registration | no repetition |
| Responsible faculty | Faculty of Science, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Offered by | Departement Biozentrum |