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| Semester | spring semester 2021 |
| Course frequency | Every spring sem. |
| Lecturers | Timm Maier (timm.maier@unibas.ch, Assessor) |
| Content | Programm: 1. Introduction: anatomy of a protein, structure determination methods, molecular graphics 2. From polypeptide to structure: interactions, folds, homology 3. Structure/function relationships: proteases, kinase, phosphotases 4. Conformational changes: allosteric control, molecular symmetry, signal transduction 5. Filaments and aggregates: cytoskeleton, prions, amyloids 6. Molecular motors 7. Membranes and membrane proteins: transporters and channels, receptors 8. DNA structure and replication, RNA biosynthesis and nucleocytoplasmic transport 9. The ribosome, protein biosynthesis, chaperones, quality control & degradation 10. Bioenergetics: Mitochondrian ATP synthesis and Photosynthesis 11. Biosynthetic networks and complexes, multienzymes and assembly lines 12. Metabolic regulation: Sensors, signalling modules and cascades and the TOR complexes 13. Questions & Answers, test exam in subgroups |
| Learning objectives | Folgende Fragen sollten am Ende des Kurses u.a. beantwortet werden können: Welche molekularen Wechselwirkungen bewirken Strukturbildung, welche wiederkehrenden Strukturmuster gibt es, inwieweit ist strukturelle Flexibilität wichtig, wie werden biologische Strukturen bestimmt, wozu werden strukturelle Erkenntnisse eingesetzt, wie können Strukturen vorhergesagt werden? Des weiteren werden die Studierenden mit ausgewählten Beispielen zu Struktur-Funktionsbeziehungen vertraut gemacht. |
| Bibliography | Vortragsmaterialien werden elektronisch zur Verfügung gestellt. Generelle Biochemie und Zellbiologie Lehrbücher können zur Vor- und Nachbearbeitung herangezogen werden: - Textbook Of Structural Biology, Anders Liljas, Lars Liljas, Jure Piskur, Göran Lindblom, Poul Nissen, Morten Kjeldgaard (ISBN 978-9812772084) - Lehninger Principles of Biochemistry, 7th Edition, David L. Nelson, Michael M. Cox (ISBN 978-1319108243) - Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level, 5th Edition, Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte W. Pratt (ISBN 978-1-118-91846-3) Detaillierte Angaben, auch zu Originalliteratur, erfolgen in den Vorlesungen. Elektronische Feedback-Möglichkeit via Mobilgerät auf www.movo.ch |
| Comments | Die Vorlesungen werden wöchentlich online gestellt. Dienstags, 10:15-12:00 Uhr finden regelmässig fakultative Zoom-Meetings statt, um Übungsaufgaben zu besprechen und Fragen zu beantworten. |
| Weblink | https://adam.unibas.ch |
| Language of instruction | English |
| Use of digital media | No specific media used |
| Interval | Weekday | Time | Room |
|---|---|---|---|
| wöchentlich | Tuesday | 10.15-12.00 | - Siehe Bemerkung, -- -- -- |
| Comments | Die Vorlesungen werden wöchentlich online gestellt. Dienstags, 10:15-12:00 Uhr finden regelmässig fakultative Zoom-Meetings statt, um Übungsaufgaben zu besprechen und Fragen zu beantworten. |
| Date | Time | Room |
|---|---|---|
| Tuesday 02.03.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 09.03.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 16.03.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 23.03.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 30.03.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 06.04.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 13.04.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 20.04.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 27.04.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 04.05.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 11.05.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 18.05.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 25.05.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Tuesday 01.06.2021 | 10.15-12.00 | - Online Präsenz -, -- |
| Modules |
Modul: Biologie 4 (Bachelor's degree subject: Biology) (Pflicht) Module: Basics in Life Sciences (Computational Chemistry) (Bachelor's Studies: Computational Sciences (Start of studies before 01.08.2018)) Module: Basics in Life Sciences (Computational Mathematics) (Bachelor's Studies: Computational Sciences (Start of studies before 01.08.2018)) Module: Biology 4 (Bachelor's Studies: Biology) (Pflicht) Module: Molecular Basis of Biology (Bachelor's Studies: Computational Sciences (Start of studies before 01.08.2018)) Module: Molecular Biology (Bachelor's Studies: Nanosciences) (Pflicht) Module: Natural Sciences (Bachelor's Studies: Computational Sciences) Module: Specialisation in Life Sciences (Bachelor's Studies: Computational Sciences (Start of studies before 01.08.2018)) |
| Assessment format | main lecture exam |
| Assessment details | Examen nach dem 4. Semester, schriftlich, 45 Minuten Anmeldefrist, Dauer, Zeitpunkt und weitere Informationen zu den Examen werden auf https://philnat.unibas.ch/de/examen veröffentlicht. (Prov. Examenstermine siehe https://bio.unibas.ch/de/pruefungen/examen/) |
| Assessment registration/deregistration | Reg.: in 'course reg.'; dereg.: Dean of Std. Off. in writing |
| Repeat examination | one repetition, best attempt counts |
| Scale | 1-6 0,5 |
| Repeated registration | no repetition |
| Responsible faculty | Faculty of Science, studiendekanat-philnat@unibas.ch |
| Offered by | Departement Biozentrum |